2022-06-27 14:05

绵羊遗传学分析增强和修改数据库

澳大利亚肉类与畜牧业(MLA)绵羊遗传学项目一直致力于为澳大利亚绵羊和山羊生产者提供世界领先的遗传评估。绵羊遗传每年都会更新遗传评估,以确保该服务保持世界领先,并为生产者带来最大可能的遗传进展。

绵羊基因公司已经为2022年实施了分析增强。这些改进包括一系列围绕两个关键主题的分析技术更新:

通过改进澳大利亚绵羊育种值(ASBV’s)的分析计算和更新的选择指标,使决策更加准确 估值。

作为今年分析增强的一部分,MLA启动了重新开发的绵羊遗传学数据库。该数据库包含有价值的系谱信息、农场和研究数据,用于从LAMBPLAN、MERINOSELECt、KIDPLAN和DOHNE评估中生成asbv。

根据MLA研究、开发和采用总经理Michael Crowley的说法,分析增强和修订的绵羊遗传数据库是向工业提供育种价值的重要组成部分。

“随着基因分型率的提高,以及比以往任何时候都更多的羊群向绵羊遗传学公司提交数据,更新行业关键数据库之一的需求非常重要。

“有超过1000只羊群提交数据,并直接与绵羊遗传学数据库系统互动。仅MERINOSELECT的评估就包括每两周评估20万个基因型,基因型的数量也大幅增加。”克劳利先生说。

今年的改进,特别是数据库重建被绵羊遗传咨询和技术委员会列为高度优先事项。我们的目标是确保这些发展能够满足未来行业的需求。

“数据库技术的进化、ASBVs动物数量的增加以及基因组信息的增长是进行这些分析增强的关键原因。这些因素,以及创建一个更实用、更灵活的系统,对将这些基因工具交付给行业至关重要,”克劳利说。

“新的数据库和增强功能将允许我们为商业育种者开发新的基因产品,并提供更容易获得最新的asbv。

克劳利先生说:“它还允许与其他行业和商业数据的集成,这对行业有利,数据捕获的利用率和灵活性意味着有更多的数据集可用于更多种需求。”

2022年的分析改进

2022年的改进包括几个更新,将影响大多数绵羊基因用户。作为这些增强的结果,用户可以期望看到育种值和指数的变化。重要的是,公羊育种者和公羊买家利用绵羊遗传学网站上可用的百分比带来重新基准自己。今年的改进包括:

用新的断奶率(WR)育种值替代原有的断奶羔羊数性状(NLW)。在母羊和美利奴羊分析指标中,新的ASBV已取代NLW。一种改进的准确性算法来处理越来越多的基因组信息,实现到e valuatio nRetirement of the孕产妇$ IndexRoutine报告数据 绵羊质量评分(DQS)对绵羊育种者的进一步更新绵羊遗传学网站ecorriedales现在从母系分析报告绵羊遗传学数据库的实施 se重建

羊遗传学database重建

精简和简化绵羊遗传学数据库是近年来的一项重要工作,特别是考虑到可供生产者使用的基因组数据的显著增长。

三个最初独立的数据库MERINOSELECt、LAMBPLAN和Resource Flock被合并在一个数据仓库中。这个单一的数据库降低了业务风险,增加了可服务性,允许轻松地组合数据源。

“生产者输入和获取遗传信息也有好处。目前,育种者会通过电子邮件发送他们的分析数据。重建数据库将允许育种者直接从绵羊遗传学网站访问定制报告,”克劳利说。

这个单一的数据库将使绵羊遗传学与其他行业和商业数据保持一致。数据捕获的利用率和灵活性意味着有更多的数据集可用于更多样化的需求。