2021-10-16 07:30

非传染性版本的SARS-CoV-2提供了强大的研究工具

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为了研究传染性像SARS-CoV-2这样的病毒,研究人员需要遵循繁琐的规程,并能够进入高生物安全性的实验室。为了使这种调查更安全、更快,并让世界各地更多的团队能够进行,病毒学家创造出了SARS-CoV-2复制子——一种不具传染性但在其他方面与真实病毒相同的自我复制rna。

复制子几乎模拟了病毒生命周期的每一个方面。它们的RNA拥有病毒复制和自我复制所需的所有信息,但缺乏制造刺突的指令,刺突是一种使病毒能够进入并感染人类细胞的蛋白质。复制子一旦被引入培养皿中的细胞中,就会产生无法扩散到邻近细胞的后代。

“有了这个系统,科学家们将能够调查SARS-CoV-2及其变体,测试针对它的药物,并评估中和抗体,所有这些都以更快的方式和较低的生物安全设置,”诺贝尔奖得主、洛克菲勒病毒学家查尔斯·m·赖斯(Charles M. Rice)说。赖斯与伯尔尼大学(University of Bern)和病毒学与免疫学研究所的沃尔克·泰尔(Volker Thiel)共同领导了这项工作。这项研究发表在《科学》杂志 上

把轮子卸下来

复制子系统已被证明在抗其他病毒(包括丙型肝炎病毒)的药物开发中发挥了重要作用。一旦Rice和其他人创造出丙型肝炎复制子,其他科学家就能够开发出有效且安全的药物,有效治疗这种慢性病毒感染。

复制子通常是通过在试管中将病毒RNA基因组克隆成DNA片段,然后用这些DNA片段人工制造RNA而产生的。但这种方法对冠状病毒RNA不起作用,因为它特别长。因此,研究人员采用了一种不同的方法,使用Volker Thiel的团队开发的平台,使从酵母中更小的片段组装冠状病毒基因组成为可能,而不是在试管中。

通过这种方法,他们创造了一个缺乏带有刺突蛋白指令的RNA片段的冠状病毒基因组。

“如果病毒是一辆赛车,我们做了一个没有轮子的版本。它有引擎,还有所有能让它移动的部件,但实际上它不能去任何地方,”莱斯实验室的博士后和联合第一作者约瑟夫·卢纳(Joseph Luna)说。 

然而,去除刺突蛋白会带来一个问题。目前许多研究都集中在sars - cov -2的这一成分上,例如,它是单克隆抗体治疗的主要靶点。为了使复制子对抗体等疗法的研究有用,研究小组将刺突蛋白与复制子一起单独表达。结果就是复制子传递粒子,一种可以将复制子传递到细胞中的一次性病毒。这些颗粒能够以类似于冠状病毒颗粒的方式进入细胞,但其传染性仅限于一个病毒生命周期。

应用范围广

科学家们说,他们的复制子可以用来探测病毒如何劫持细胞自身的机制,以及它如何产生新的自我复制。此外,它们可能使识别人类蛋白质 成为可能,没有这些蛋白质,病毒就无法复制。为了证明这一概念,该团队检测了TMEM41B的效果,TMEM41B是一种人类蛋白质,此前被发现是SARS-CoV-2复制所必需的。就像真正的冠状病毒一样,复制子无法在缺乏这种蛋白质的细胞中复制。

复制子还可以用来筛选化学库中能够阻止病毒复制的药物化合物。在其他实验中,该团队将复制子与瑞德西韦(redesivir)一起孵育,瑞德西韦是一种已知能抑制病毒的抗病毒药物。“我们发现,它抑制复制子的浓度与抑制实际病毒的浓度相同,” 的共同第一作者、莱斯实验室的博士后Inna Ricardo-Lax说。“这表明复制子系统可以作为 SARS-CoV-2 测试不同药物的可靠替代品。”